Католицизм, равно как и всё христианство в целом, был принесен в Японию благодаря португальским исследователям и миссионерам, а также благодаря ордену иезуитов, в первую очередь испанцу Франциску Ксавьерию и итальянцу Алессандро Валиньяно. Ода Нобунага, правитель Японии, поощрял распространение христианской веры по стране. Однако его преемник, Хидэёси Тоётоми в 1587 году издал указ о запрете миссионерской деятельности. Гонения на христиан продолжались.
В 1862 году в Иокогаме П. С. Жирард построил первую (за несколько столетий) католическую церковь в Японии.
В 1867 году более 20 католиков были арестованы, а в 1868 году вышел указ о запрете исповедания христианства:
«Так как презренная религия христиан строго воспрещена, то каждый лично должен перед своими властями заявить свое отречение от принадлежности к оной и указать на тех, кто ее придерживается, во избежание подозрительного к себе отношения»