Родился во Флоренции в семье врача, но бежал из дома, разочаровавшись во флорентийских нравах. Принял постриг в доминиканском монастыре в Болонье, где вёл суровую жизнь и отказался от денег, которые имел. Настоятель монастыря довольно быстро разглядел в молодом человеке талант проповедника и этот талант развил. Окончив своё обучение в монастыре, Савонарола прибыл в Рим, где остановился у собратьев по Ордену. В своих проповедях он открыто выступает против церковной роскоши, а свободное от молитв и проповедей время посвящает изучению сочинений Отцов Церкви.