Родом из татарского племени, почти полностью уничтоженного по приказу Чингисхана. Была захвачена в плен Угэдэем, сыном Чингисхана. Стала его любимой женой и родила от него сына, Хагана, которого Угэдэй хотел назвать своим наследником. Однако после смерти Угэдэя его старшая жена, Дорегене-хатун, захватила власть и сделала великим ханом своего сына, Гуюка.
Дорегене-хатун сжила Хагана со свету, а самой Боракчин пришлось спасаться бегством. В поисках покровителя она обратилась к Бату-хану и вскоре стала его женой. Это привело к тому, что Бату-хан выступил против Гуюка и на курултае, собранном после смерти последнего, поддержал дом Толуя. Сейчас Боракчин-хатун является старшей женой Бату-хана. Приезжающие в Золотую Орду русы величают её не иначе как “царица Боракчин”.